Der Magistrat von Eisenstadt ist die Verwaltung der Stadt. Er ist für die Umsetzung der Beschlüsse des Gemeinderates und die Erfüllung der städtischen Aufgaben zuständig. Der Magistrat besteht aus dem Bürgermeister, dem Vizebürgermeister und den Stadträten. Er ist für die Bereiche Finanzen, Wirtschaft, Soziales, Kultur, Bildung und Verkehr zuständig. Der Magistrat ist ein wichtiger Bestandteil der Stadtverwaltung und trägt zur Entwicklung und Förderung der Stadt bei.